1、堿基G對TAMRA的猝滅機理研究。堿基G能夠有效猝滅TAMRA,這種猝滅必須通過近距離接觸實現(xiàn),機理是光誘導(dǎo)電子傳遞(PET)猝滅方式。G位于TAMRA的同鏈或是異鏈時體現(xiàn)的整體猝滅效果一致,但猝滅形式不同:同鏈G對TAMRA的PET作用效率更高;互補鏈的G占據(jù)分子結(jié)構(gòu)優(yōu)勢,PET熒光組分比例更高。G個數(shù)越多PET作用越明顯,但沒有觀察到DNA鏈內(nèi)各個堿基G之間的電荷傳遞作用。利用G能猝滅TAMRA熒光的性質(zhì)可以動態(tài)監(jiān)測雜交過程及定量衡量雜交程度,還可以得到一些特殊的結(jié)構(gòu)信息,如發(fā)夾結(jié)構(gòu)及分子鏈柔韌性等。

　2、TAMRA作為能量受體與供體熒光素(FAM)形成供受體對定量檢測DNA分子結(jié)構(gòu)的研究。FAM和TAMRA作為熒光共振能量轉(zhuǎn)移作用(FRET)的供受體對,F(o)rster距離為62.4(A)。12bp、15bp DNA單標(biāo)記鏈的FRET實驗中,發(fā)現(xiàn)從熒光壽命均可觀察到較明顯的FRET現(xiàn)象,但是穩(wěn)態(tài)光譜卻只能觀察到供體熒光的下降,而受體熒光無增強。此現(xiàn)象最終證實為增強的受體熒光被互補鏈的鳥嘌呤PET猝滅,故無法觀察到受體熒光。利用加入受體前后供體熒光壽命的變化計算得到12bp、15bp DNA單標(biāo)記鏈、15bp DNA雙標(biāo)記鏈的鏈長分別為55.5(A)、60.8(A)、56.4(A),與DNA的B構(gòu)型模型的結(jié)構(gòu)信息基木相符。

　　3、TAMRA標(biāo)記在DNA上的構(gòu)型研究。通過穩(wěn)態(tài)光譜和瞬態(tài)光譜對TAMRA化學(xué)鍵合在不同序列。DNA鏈的研究,對TAMRA-DNA復(fù)合物的三種不同熒光壽命組分予以歸屬:第一,短壽命組分為G對TAMRA的PET猝滅途徑的壽命組分;第二,中問壽命值與自由TAMRA相近,為TAMRA較自由伸展在溶液中的狀態(tài);第三,長壽命組分是TAMRA與DNA堿基形成的基態(tài)復(fù)合物的熒光組分。

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